Le projet
Leucegene a pour but de paver la voie en médecine personnalisée pour les patients souffrant de leucémie myéloide aigüe (LMA).
La cohorte totalise actuellement 529 échantillons primaires prélevés et maintenus par la
BCLQ parmi lesquels 452 sont des échantillons de LMA dont 373 sont classés
comme des échantillons "LMA diagnostiques" (excluant les échantillons de leucémie promyélocytaire aiguë (LPA)).
Pour plus détails concernant la façon de citer le projet Leucegene, référez-vous à la section FAQ.
Pour accéder aux données, naviguez dans les différentes section du Portail de Données Leucegene.
Notez que les données transcriptomiques de Leucegene ont aussi été déposées dans la base de données publique
"Gene Expression Omnibus" (GEO).
Plusieurs outils utilisant les données Leucegene ont été développés par l'équipe. Parmi ceux-ci:
- Lasa, un portail présentant l'analyse et les données de surfaceome.
- SPAT, un outil qui évalue la probablité qu'une protéine soit présente à la surface d'une cellule.
- KM, outil pour la détéction ciblée sans alignement de mutations dans une région d'intérêt préalablement sélectionnée avec l'aide de l'outil: KM-target.
- EPCY, un outil pour évaluer la capacité d'un gène à être un biomarqueur prédictif.
- MiSTIC, une plateforme intégrée pour analyser l'hétérogénéicité au niveau du transcriptome.
- HemoGene, portail qui présente l'expression génique par type de cellules hémapoiétiques.
- VisMut, un portail pour l'exploration de mutations détéctées au préalable à travers plusieurs projets de séquençage.